Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAK1Q9UPV9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms