Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD3Q9UJU5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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FOXD3Q9UJU5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXD3Q9UJU5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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