Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms