Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MLH3Q9UHC1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms