Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLIP2Q9UDT6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms