Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LRP1BQ9NZR2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms