Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKIRAS1Q9NYS0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms