Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DDIT4Q9NX09 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms