Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SALL1Q9NSC2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms