Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ASCL3Q9NQ33 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms