Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ROPN1BQ9BZX4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms