Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms