Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms