Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ALPK1Q96QP1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ALPK1Q96QP1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ALPK1Q96QP1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ALPK1Q96QP1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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