Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSPG4P5Q96PW8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms