Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCG3Q8WXD2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms