Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms