Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NEDD1Q8NHV4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NEDD1Q8NHV4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms