Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms