Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AMER3Q8N944 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms