Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGDCC3Q8IVU1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGDCC3Q8IVU1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms