Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B0

CCDC91, Coiled-coil domain-containing protein 91, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC91Q7Z6B0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC91Q7Z6B0 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms