Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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USP43Q70EL4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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