Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP31Q70CQ4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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