Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC174Q6PII3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms