Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFWD3Q6PCD5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RFWD3Q6PCD5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms