Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CARMIL2Q6F5E8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms