Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms