Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC39A12Q504Y0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms