Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PTPRNQ16849 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PTPRNQ16849 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PTPRNQ16849 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PTPRNQ16849 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPRNQ16849 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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