Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms