Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMA3Q16787 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMA3Q16787 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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