Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLPPQ16740 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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