Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NRF1Q16656 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms