Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NTRK2Q16620 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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NTRK2Q16620 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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NTRK2Q16620 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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NTRK2Q16620 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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NTRK2Q16620 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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