Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms