Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC85BQ15834 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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