Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF11Q15544 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF11Q15544 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF11Q15544 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF11Q15544 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF11Q15544 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF11Q15544 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF11Q15544 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF11Q15544 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF11Q15544 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms