Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DDAH2-219ENST00000483792 898 ntTSL 511.67□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-205ENST00000452322 1391 ntTSL 311.44□□□□□ -0.581e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SCAMP5-212ENST00000567529 966 ntTSL 211.2□□□□□ -0.622e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 NAMPT-205ENST00000424768 1147 ntTSL 410.79□□□□□ -0.681e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP1-204ENST00000522774 3078 ntTSL 1 (best)10.61□□□□□ -0.711e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 FBXL19-AS1-201ENST00000563777 3951 ntBASIC10.36□□□□□ -0.751e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PYM1-201ENST00000302533 890 ntTSL 310.15□□□□□ -0.781e-12■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-12■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 CAPZA1-205ENST00000485542 739 ntTSL 29.52□□□□□ -0.891e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-210ENST00000635675 1404 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.931e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.083e-17■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 NAMPT-204ENST00000417537 300 ntTSL 48.02□□□□□ -1.131e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-212ENST00000642072 338 nt7.88□□□□□ -1.151e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-210ENST00000529826 2423 ntTSL 57.72□□□□□ -1.171e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.191e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-216ENST00000532384 3237 ntTSL 57.18□□□□□ -1.261e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-208ENST00000528229 573 ntTSL 26.89□□□□□ -1.311e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MRPS6-203ENST00000482679 1956 ntTSL 26.21□□□□□ -1.421e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.07□□□□□ -1.441e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 55.61□□□□□ -1.511e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.551e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.593e-14■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.681e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 CHM-202ENST00000467744 2040 ntTSL 54.3□□□□□ -1.723e-14■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.731e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-219ENST00000534269 4239 ntTSL 1 (best)4.1□□□□□ -1.751e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MRPS6-204ENST00000483977 3934 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.791e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.811e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-212ENST00000530429 3167 ntTSL 53.48□□□□□ -1.851e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-206ENST00000527613 5640 ntTSL 1 (best)3.07□□□□□ -1.921e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.931e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 BCLAF1-224ENST00000640069 7719 ntTSL 51.38□□□□□ -2.191e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-204ENST00000392381 2833 ntTSL 1 (best)20.9■□□□□ 0.943e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-207ENST00000419227 1771 ntTSL 214.34□□□□□ -0.113e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-215ENST00000448528 2977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.663e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-201ENST00000346964 5034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.743e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-205ENST00000392382 2690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.783e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.083e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-214ENST00000447466 858 ntTSL 1 (best)8.28□□□□□ -1.083e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-219ENST00000456699 629 ntTSL 37.81□□□□□ -1.163e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-223ENST00000471733 2605 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.323e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-203ENST00000392380 716 ntTSL 36.29□□□□□ -1.43e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-218ENST00000453607 539 ntTSL 46.26□□□□□ -1.413e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.543e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.553e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.713e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.753e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.041e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-211ENST00000442590 577 ntTSL 311.35□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-209ENST00000428279 1525 ntTSL 510.77□□□□□ -0.691e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-212ENST00000450319 549 ntTSL 310.42□□□□□ -0.741e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.371e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 IL1R1-213ENST00000452403 609 ntTSL 35.99□□□□□ -1.451e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LEMD1-209ENST00000625854 516 ntTSL 48.07□□□□□ -1.123e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.243e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 NECTIN2-206ENST00000592018 812 ntTSL 313.95□□□□□ -0.182e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.859e-13■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 521.13■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.31e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 FBXW11-206ENST00000518752 310 ntTSL 53.73□□□□□ -1.812e-8■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 59.69□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ZNRF1-207ENST00000568351 964 ntTSL 313.27□□□□□ -0.293e-25■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ZNRF1-210ENST00000568844 5331 nt13.01□□□□□ -0.333e-25■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.013e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-13■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.592e-13■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 COPZ1-202ENST00000455864 880 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.662e-13■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-13■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 COPZ1-209ENST00000550171 1026 ntTSL 28.78□□□□□ -12e-13■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SLC25A39-217ENST00000593166 797 ntTSL 315□□□□□ -0.012e-12■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 AUP1-203ENST00000462297 457 ntTSL 39.46□□□□□ -0.92e-39■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.792e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.772e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.712e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.682e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.582e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-212ENST00000426518 874 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-9■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 OGG1-211ENST00000425665 930 ntTSL 314.16□□□□□ -0.142e-9■■■□□ 14.9
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 180.2 ms