Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMC1AQ14683 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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