Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FAM53BQ14153 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms