Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CKAP5Q14008 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms