Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHROOM2Q13796 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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SHROOM2Q13796 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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SHROOM2Q13796 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHROOM2Q13796 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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