Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RUNX3Q13761 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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