Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALCAMQ13740 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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