Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GPM6BQ13491 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPM6BQ13491 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms