Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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FOXE3Q13461 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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