Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LSAMPQ13449 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LSAMPQ13449 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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