Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGB3BPQ13352 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGB3BPQ13352 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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ITGB3BPQ13352 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB3BPQ13352 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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