Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNDQ07001 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHRNDQ07001 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms